粉塵有功也有過，其過之一是污染大氣，危害人類的健康。飄逸在大氣中的粉塵往往含有許多有毒成分，如鉻、錳、鎘、鉛、汞、砷等。當人體吸入粉塵后，小于5μm的微粒，極易深入肺部，引起中毒性肺炎或矽肺，有時還會引起肺癌。沉積在肺部的污染物一旦被溶解，就會直接侵入血液，引起血液中毒，未被溶解的污染物，也可能被細胞所吸收，導致細胞結構的破壞。此外，粉塵還會沾污建筑物，使有價值的古代建筑遭受腐蝕。降落在植物葉面的粉塵會阻礙光合作用，抑制其生長。
粉塵其過之二是爆炸危害。相傳，早在風車水磨時代，就曾發生過一系列磨坊糧食粉塵爆炸事故。到了20世紀，隨著工業的發展，粉塵爆炸事故更是屢見不鮮，爆炸粉塵的種類也越來越多。據統計，1913～1973年間美國僅工農業方面就發生過72次比較嚴重的粉塵爆炸事故。1919年俄亥俄州一家淀粉廠發生粉塵爆炸，廠房幾乎全部被毀，有43人喪生。日本1952～1975年共發生重大粉塵爆炸事故177次，累計死亡75人，受傷410人。
1977年美國路易斯安那州一座現代化糧庫發生爆炸，造成一半以上糧食簡倉被毀，連辦公大樓也未幸免，36人死亡，直接經濟損失達3000萬美元。英國和加拿大在化工和造紙等行業中也發生過多起粉塵爆炸事故，僅英國就243次，死傷204人。
1987年3月15日，哈爾濱亞麻紡織廠發生的爆炸事故，死亡56人，傷179人，廠房設備嚴遭破壞。
2014年8月2日上午7時37分許，江蘇昆山開發區中榮金屬制品有限公司汽車輪轂拋光車間在生產過程中發生爆炸。目前已造成97人死亡，163人受傷，直接經濟損失3.51億元。事故原因直接原因是：事故車間除塵系統較長時間未按規定清理，鋁粉塵集聚。除塵系統風機開啟后，打磨過程產生的高溫顆粒在集塵桶上方形成粉塵云。1號除塵器集塵桶銹蝕破損，桶內鋁粉受潮，發生氧化放熱反應，達到粉塵云的引燃溫度，引發除塵系統及車間的系列爆炸。
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